Вы немного перепутали назначение этапов развития и оперативных сценариев.
Оперативные сценарии "помнят" параметры режима: положение выключетелей, нагрузка, генерация, положение РПН трансформаторов....
Этапы развития помнят параметры элементов: длина линий, тип провода линий и т.д.
В вашем случае:
1 картинка - Нет оперативных сценариев. Есть этапы развития. - включенные этапы развития не следят и не запоминают положение выключателей линий. Линии отключены в исходной схеме.
2 картинка - применяется оперативный сценарий, который как видно "помнит" что линии включены. Поэтому линии и включаются.
В итоге: если надо вносить "режимные" настройки модели - используем оперативные сценарии.
Если надо поменять параметры элементов (или добавить/удалить элементы) используйте этапы развития.